Управление системой предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций осуществляется в соответствии с требованиями  cтандарта организации «Предупреждение и ликвидация чрезвычайных ситуаций в АО «НК «ҚТЖ» и его дочерних организациях» .

Работники, обнаружившие нарушение экологических требований, норм, правил и инструкций или опасность, угрожающую жизни и здоровью людей, а также возможность загрязнения окружающей среды, обязаны незамедлительно принять все зависящие от них меры по устранению или локализации возникшей ситуации и сообщить об этом диспетчеру или руководителям структурных подразделений и дочерних организаций в соответствии со стандартом «Управление происшествиями с определением их коренных причин в АО «НК «ҚТЖ» » и его дочерних организациях». 

Структурные подразделения и дочерние организации информируют уполномоченный орган в области охраны окружающей среды о происшедших авариях с выбросом и сбросом загрязняющих веществ в окружающую среду в течение двух часов с момента их обнаружения в соответствии с требованиями Экологического кодекса. Также данную информацию предоставляют в курирующее подразделение. 

Ликвидация чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера и их последствий проводится в соответствии с требованием Закона Республики Казахстан «О гражданской защите». Ликвидация последствий аварийных ситуаций осуществляется в соответствии с требованиями Стандарта по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций в АО «НК «ҚТЖ» и его дочерних организациях, утверждаемого отдельным локальным актом Компании.